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期刊论文 4

年份

2024 1

2021 1

2020 1

2017 1

关键词

G蛋白偶联受体 1

γ-氨基丁酸A型受体 1

人工智能 1

刚性 1

单萜 1

哺乳动物细胞文库 1

多组学 1

烟碱型乙酰胆碱受体 1

程序性细胞死亡配体-1 1

精油 1

纳米拓扑结构 1

细胞外基质 1

细胞行为 1

芳樟醇 1

药物发现 1

表位定向 1

诱饵程序性细胞死亡蛋白-1 1

配体 1

黏附配体 1

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人工智能加速GPCR配体的发现 Review

陈伟, 宋驰, 冷梁, 张三印, 陈士林

《工程(英文)》 2024年 第32卷 第1期   页码 19-29 doi: 10.1016/j.eng.2023.09.011

摘要: 然而,传统的GPCR配体发现方法需要投入大量的时间和资源。人工智能方法的出现为GPCR配体的识别和优化提供了有利的工具,改变了GPCR配体发现的研究方式。本文从数据资源、数据描述、模型设计等方面介绍了如何利用人工智能方法构建GPCR配体发现模型,并分析了人工智能方法在GPCR药物领域的应用;提出了一种基于人工智能方法整合多组学数据的GPCR配体筛选策略;人工智能方法与多学科的交叉融合将提高GPCR配体发现的效率。

关键词: G蛋白偶联受体     配体     人工智能     多组学     药物发现    

细胞行为在基质刚性和纳米拓扑结构上的生物物理调控 Review

Yong Yang, Kai Wang, 顾晓松,Kam W. Leong

《工程(英文)》 2017年 第3卷 第1期   页码 36-54 doi: 10.1016/J.ENG.2017.01.014

摘要:

细胞外基质(ECM) 的刚性和纳米拓扑结构影响生物体发育及生理和病理进程因此,这些生物物理特征被用于调节细胞黏附铺展至增殖、分化的各种细胞行为。描述细胞行为的生物物理调节对合理设计新型生物材料植入物和医疗装置十分关键已有学者就基质刚和纳米拓扑结构特征对细胞行为的影响分别进行了综述,然,刚和纳米拓扑结构与细胞行为的交织影响尚未有人总结。此次,我们首次综述了基质刚性和纳米拓扑结构对细胞行为的影响,然后聚焦于生物物理信号从整合素到细胞核的细胞内传,并试图将细胞行为的细胞外调节与基质的生物物理学特征联系在起最后,我们讨论了在剖析细胞行为的生物物理调节和将基质的刚和纳米拓扑结构生物力学特转化到组织工程和再生医学时存在的挑战

关键词: 细胞外基质     刚性     纳米拓扑结构     黏附配体     细胞行为    

单萜类化合物芳樟醇、甲基丁香酚、草蒿脑和香茅醛对配体门控离子通道的作用模式 Article

Amy S. Li, Akimasa Iijima, Junhao Huang, Qing X. Li, Yongli Chen

《工程(英文)》 2020年 第6卷 第5期   页码 541-545 doi: 10.1016/j.eng.2019.07.027

摘要:

在传统的医学治疗中,精油被用作镇静剂、抗惊厥剂以及局部麻醉剂,还可以用作储藏食品、水果、蔬菜和谷物等的防腐剂,同时,它还能用作食品生产的生物农药。芳樟醇(LL)以及其他一些主要组分,如甲基丁香酚(ME)、草蒿脑(EG)和香茅醛是许多精油(如罗勒精油)中的活性化学成分。罗勒精油以及上述单萜类化合物在驱除害虫等方面有明显的功效。然而,这些化学成分的作用机制尚不明确。众所周知,γ-氨基丁酸A型受体(GABAAR)和烟碱型乙酰胆碱受体(nAChR)是目前市场上使用的合成杀虫剂的主要分子靶标。此外,GABAAR靶向治疗也已经有了数十年的临床应用实践,如巴比妥类药物和苯二氮类药物。在本研究中,我们研究了LL、ME、EG和香茅醛对GABAAR和nAChR的电生理作用,以进一步了解它们作为传统药物治疗剂和杀虫剂的多功能性。研究结果表明,LL对GABAAR和nAChR均有抑制作用,这或许可以解释LL的杀虫活性。LL是GABAAR的一种浓度依赖性、非竞争性抑制剂,因为在实验中我们发现,小鼠α1β3γ2L GABAAR的γ-氨基丁酸(GABA)半最大效应浓度(EC50)值不受LL影响:在LL不存在或存在5 mmol·L–1 LL的情况下,该半最大效应浓度值分别为(36.2 ± 7.9) μmol·L–1以及(36.1 ± 23.8) μmol·L–1。LL对GABAAR的半抑制浓度(IC50)约为3.2 mmol·L–1。考虑到在精油之中存在着多种单萜类化合物,所以LL可能与此前被表征为GABAAR激动剂和正变构调节物的ME以及其他单萜类化合物具有协同作用,这为LL的镇静、抗惊厥效用和杀虫活性提供了一种可能的解释。

关键词: 精油     γ-氨基丁酸A型受体     芳樟醇     单萜     烟碱型乙酰胆碱受体    

基于表位定向细胞库筛选高亲和力PD-1突变体诱骗分子 Article

刘昊, 乔春霞, 胡乃静, 王志宏, 王晶, 冯健男, 沈倍奋, 马远方, 罗龙龙

《工程(英文)》 2021年 第7卷 第11期   页码 1557-1565 doi: 10.1016/j.eng.2020.11.011

摘要: text-align:justify; margin:0cm 0cm 0.0001pt">抗程序性细胞死亡蛋白-1(programmed cell death protein-1, PD-1)/程序性细胞死亡配体通过对PD-1及其配体(即PD-L1和PD-L2)或抗体Opdivo的理论结合分析,建立了PD-1的一个小库容量、表位定向的哺乳动物细胞文库。

关键词: 诱饵程序性细胞死亡蛋白-1     程序性细胞死亡配体-1     哺乳动物细胞文库     表位定向    

标题 作者 时间 类型 操作

人工智能加速GPCR配体的发现

陈伟, 宋驰, 冷梁, 张三印, 陈士林

期刊论文

细胞行为在基质刚性和纳米拓扑结构上的生物物理调控

Yong Yang, Kai Wang, 顾晓松,Kam W. Leong

期刊论文

单萜类化合物芳樟醇、甲基丁香酚、草蒿脑和香茅醛对配体门控离子通道的作用模式

Amy S. Li, Akimasa Iijima, Junhao Huang, Qing X. Li, Yongli Chen

期刊论文

基于表位定向细胞库筛选高亲和力PD-1突变体诱骗分子

刘昊, 乔春霞, 胡乃静, 王志宏, 王晶, 冯健男, 沈倍奋, 马远方, 罗龙龙

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